Со стороны нервной системы: судороги, сонливость, бессонница, сопорозное состояние, головная боль, тремор, дизартрия, головокружение, спутанность сознания и нарушение ориентации, сопровождавшееся потерей памяти, тревожность, периферический неврит, психоз, суицидальные настроения, возможно с попытками самоубийства, изменения характера, эйфория, депрессия, повышенная раздражительность, агрессивность, периферический парез, гиперрефлексия, парестезия, большие и малые приступы клонических судорог и кома, «кошмарные» сновидения, мышечные подергивания.
Со стороны пищеварительной системы: тошнота, изжога, диарея, в особенности у пожилых пациентов с ранее существовавшими заболеваниями печени, повышение активности аминотрансфераз печени.
Со стороны сердечно-сосудистой системы: отмечалась обострение хронической сердечной недостаточности у пациентов, принимавших от 1 до 1,5 г циклосерина в сутки. К другим установленным побочным эффектам относятся: аллергические реакции, зуд, сыпь, дефицит цианокобаламина и фолиевой кислоты, мегалобластная и сидеробластная анемия, лихорадка, усиление кашля.